MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022784	GCC	2	6	247376	247381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625474
4502	NC_022784	TGG	2	6	247399	247404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625474
4503	NC_022784	GGA	2	6	247456	247461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625474
4504	NC_022784	GTG	2	6	247472	247477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625474
4505	NC_022784	CGA	2	6	247497	247502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625474
4506	NC_022784	A	6	6	247502	247507	100 %	0 %	0 %	0 %	557625474
4507	NC_022784	GTT	2	6	247518	247523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625474
4508	NC_022784	GGC	2	6	247618	247623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_022784	GC	3	6	247627	247632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_022784	TTTA	2	8	247643	247650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_022784	GAAC	2	8	247749	247756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_022784	GGC	2	6	247760	247765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_022784	TGC	2	6	247807	247812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_022784	TAG	2	6	247859	247864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_022784	TGG	2	6	247885	247890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_022784	TGG	2	6	247961	247966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_022784	GAT	2	6	248010	248015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_022784	GCA	2	6	248059	248064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_022784	GTGA	2	8	248112	248119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_022784	AGA	2	6	248176	248181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_022784	CAG	2	6	248202	248207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_022784	GTT	2	6	248233	248238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_022784	ATT	2	6	248243	248248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_022784	GCT	2	6	248313	248318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_022784	AGG	2	6	248392	248397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_022784	GGC	2	6	248413	248418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_022784	TGT	2	6	248534	248539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_022784	CTT	2	6	248667	248672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_022784	CTT	2	6	248690	248695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_022784	TGC	2	6	248732	248737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_022784	GTC	2	6	248744	248749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_022784	TCGTG	2	10	248753	248762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4533	NC_022784	GGA	2	6	248858	248863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_022784	GAT	2	6	248871	248876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_022784	AC	3	6	248909	248914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_022784	GTC	2	6	248974	248979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_022784	AC	3	6	249077	249082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_022784	AGG	2	6	249136	249141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_022784	CCT	2	6	249218	249223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_022784	CTG	2	6	249237	249242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_022784	GCC	2	6	249274	249279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_022784	GTG	2	6	249313	249318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_022784	TGC	2	6	249369	249374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_022784	T	6	6	249415	249420	0 %	100 %	0 %	0 %	557625475
4545	NC_022784	CTG	2	6	249451	249456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
4546	NC_022784	CTT	2	6	249483	249488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625475
4547	NC_022784	TTCT	2	8	249505	249512	0 %	75 %	0 %	25 %	557625475
4548	NC_022784	GCT	2	6	249519	249524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
4549	NC_022784	TG	3	6	249538	249543	0 %	50 %	50 %	0 %	557625475
4550	NC_022784	ACT	2	6	249557	249562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625475
4551	NC_022784	CAG	2	6	249627	249632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625475
4552	NC_022784	TGC	3	9	249641	249649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
4553	NC_022784	GTC	2	6	249667	249672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
4554	NC_022784	T	6	6	249679	249684	0 %	100 %	0 %	0 %	557625475
4555	NC_022784	TGG	2	6	249732	249737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625475
4556	NC_022784	GCTGG	2	10	249750	249759	0 %	20 %	60 %	20 %	557625475
4557	NC_022784	TGC	2	6	249763	249768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625475
4558	NC_022784	TTTG	2	8	249779	249786	0 %	75 %	25 %	0 %	557625475
4559	NC_022784	TGC	2	6	249824	249829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625476
4560	NC_022784	CTT	2	6	249867	249872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625476
4561	NC_022784	GGT	2	6	249908	249913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625476
4562	NC_022784	GGA	2	6	249917	249922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625476
4563	NC_022784	GC	3	6	249944	249949	0 %	0 %	50 %	50 %	557625476
4564	NC_022784	TTC	2	6	249963	249968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625476
4565	NC_022784	GT	3	6	249990	249995	0 %	50 %	50 %	0 %	557625476
4566	NC_022784	CTG	2	6	250052	250057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625476
4567	NC_022784	GGTT	2	8	250089	250096	0 %	50 %	50 %	0 %	557625476
4568	NC_022784	TGT	2	6	250110	250115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625476
4569	NC_022784	TTA	2	6	250121	250126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625476
4570	NC_022784	AG	3	6	250194	250199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_022784	CGG	2	6	250219	250224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_022784	GTG	2	6	250228	250233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_022784	CAG	2	6	250359	250364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_022784	CAGC	2	8	250406	250413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_022784	CCTC	2	8	250428	250435	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4576	NC_022784	AGGGC	2	10	250492	250501	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4577	NC_022784	CTG	2	6	250555	250560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_022784	CTT	2	6	250569	250574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_022784	ACAAAA	2	12	250639	250650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4580	NC_022784	CTG	2	6	250690	250695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_022784	CTT	2	6	250797	250802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_022784	GC	4	8	250888	250895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_022784	GGTGCT	2	12	250902	250913	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4584	NC_022784	GCT	2	6	251039	251044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_022784	AGC	2	6	251158	251163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_022784	TCA	2	6	251167	251172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_022784	ACTT	2	8	251189	251196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_022784	TGAG	2	8	251221	251228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_022784	GGGTT	2	10	251229	251238	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_022784	GA	3	6	251257	251262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_022784	GC	3	6	251280	251285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_022784	CAG	2	6	251325	251330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_022784	ACA	2	6	251360	251365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_022784	CG	3	6	251381	251386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_022784	ATG	3	9	251395	251403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_022784	AGT	2	6	251466	251471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_022784	ACT	2	6	251475	251480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_022784	N	247	247	251529	251775	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_022784	CGC	2	6	251776	251781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_022784	CG	3	6	251785	251790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_022784	ATG	3	9	251799	251807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_022784	AGT	2	6	251870	251875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_022784	ACT	2	6	251879	251884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_022784	CTG	2	6	251928	251933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626121
4605	NC_022784	AAT	2	6	251971	251976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557626121
4606	NC_022784	ATT	2	6	251998	252003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557626121
4607	NC_022784	TGGT	2	8	252019	252026	0 %	50 %	50 %	0 %	557626121
4608	NC_022784	CCG	2	6	252080	252085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_022784	GCA	2	6	252177	252182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_022784	TGTT	2	8	252190	252197	0 %	75 %	25 %	0 %	557625477
4611	NC_022784	CTC	2	6	252224	252229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625477
4612	NC_022784	CGCA	2	8	252241	252248	25 %	0 %	25 %	50 %	557625477
4613	NC_022784	GAC	2	6	252267	252272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625477
4614	NC_022784	GCT	2	6	252332	252337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625477
4615	NC_022784	GAG	2	6	252344	252349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625477
4616	NC_022784	TCC	2	6	252354	252359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625477
4617	NC_022784	TTC	2	6	252365	252370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625477
4618	NC_022784	GCCC	2	8	252379	252386	0 %	0 %	25 %	75 %	557625477
4619	NC_022784	CGC	2	6	252397	252402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625477
4620	NC_022784	CTT	2	6	252515	252520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625477
4621	NC_022784	CAC	2	6	252602	252607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625477
4622	NC_022784	GCA	2	6	252658	252663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625477
4623	NC_022784	CTC	3	9	252850	252858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625477
4624	NC_022784	CCT	2	6	252909	252914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625477
4625	NC_022784	GTTG	2	8	252954	252961	0 %	50 %	50 %	0 %	557625477
4626	NC_022784	T	6	6	252999	253004	0 %	100 %	0 %	0 %	557625478
4627	NC_022784	TTG	2	6	253021	253026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625478
4628	NC_022784	AAT	2	6	253075	253080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625478
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